Desde el año 2006 lleva este club anteriormente denominado Atlético Marbellí que de la mano de Moñi (leyenda del fútbol de Marbella) y su familia formó este proyecto futbolistico para hacerse un hueco entre los diferentes clubes ya existentes en la ciudad con intención de formar jóvenes promesas en las distintas categorías del fútbol federado de la provincia malagueña y con un proyecto amateur en categoría senior dónde ha conseguido cotas como disputar la anterior 1ªAndaluza biprovincial e incluso resarcirse tras sus descensos hasta la 2ªAndaluza malagueña. Desde la llegada del expresidente del Marbella FC Alexander Gingber el proyecto tomó una envergadura semiprofesional y se le dió alicientes y valor con restructuración en las categorías filiales formando un proyecto ambicioso dónde en Primera Andaluza se consiguió el campeonato y por consiguiente ascenso en el curso 2023/24 en un bonito duelo ante el CD Atco Marbella Paraíso (club de la propia ciudad) y durante el verano surgió la posibilidad de ocupar la vancate surgida por el Vélez FC el cual estaba asumido con deudas y le era imposible salir en competición nacional siendo el club marbellí el que ocupase su plaza tras abonar las premisas impuesta por la RFEF siendo la temporada 2024/25 la primera en su historia en el grupo noveno de la Tercera División (quinta categoría del fútbol nacional).