En 1982 Don Francisco Abril, Don Alfonso Martín, Don Manuel Gallardo, Don Antonio Romero y Don Jorge Abril crearon Los Villares Club de fútbol.
En 2004 la directiva cambió cogiendo las riendas Don Ángel Cabrera.
Poco después, el que hasta entonces era vice-presidente; Pedro Díaz, se hace presidente y con él al frente el club logra sus mejores años deportivos consolidando en la Tercera División del fútbol español al club.
Después de tres temporadas en dicha categoría, la directiva decidía dimitir vista la dificultad para dar continuidad al proyecto y se abría entonces un periodo para que se presentasen aquellas candidaturas que quisieran hacerse cargo del club. Por desgracia, y a pesar de que el Ayuntamiento de la localidad ofreció su ayuda a aquellos que decidiesen dar un paso al frente, nadie se atrevió a hacerse con las riendas de la entidad villariega y esta vio cómo su equipo senior desaparecía.
En 2017 Don Luis Heredia coge las riendas del club durante tres año, viviendo un ascenso de segunda a primera andaluza.
El 6 de Junio de 2020 Don Jesús Melero se hace con la presidencia del club, pero el 11/02/2021 presenta su dimisión, cogiendo el cargo temporal el hasta entonces vicepresidente; Antonio J. Barranco.