El día 7 de septiembre de 2007, nace el Inter de Jaén C. F. Una idea que partió de un grupo de amigos a los que les apasionaba el fútbol. A lo largo de estos años, han participado en diferentes ligas de fútbol 7 y fútbol sala en la propia capital jienense siendo sus tres primeras temporadas competieron en fútbol sala (las dos primeras a nivel federado, en la Segunda Andaluza senior). A partir de ahí centramos nuestra actividad en el fútbol 7 (En las seis últimas jugando la Liga Fut7Jaén).
Después de diez temporadas, llegaría la temporada debut federativamente hablando en el curso 2017/2018, es el único club de la provincia que da variante a diversas modalidades de la oferta federada del fútbol provincial como su participación en féminas, veteranos y fútbol inclusivo. Cuenta con un ascenso a Primera Andaluza como mayor logro en estos años de competición bajo el amparo de la FJF.